A fertőző betegségek nagy része összefügg a környezettel, hiszen a fertőzést okozó mikroorganizmusok gyakran a környezet közvetítésével jutnak el az emberi szervezethez. A közvetítő közeg lehet a felszíni víz, a talaj és a talajvíz, a levegő valamint az élővilág bármelyik tagja (rovarok, háziállatok, stb.
A fertőző mikroorganizmusok forrása lehet emberi vagy állati eredetű anyag, szennyvíz, hulladék, trágya, és az emberbe bejuthat belégzéssel, bőrkontaktus útján és a táplálkozással, ivóvízzel és élelmiszerekkel.